Bertahun-tahun setelah tragedi besar yang menewaskan 90% orang di Jepang, tiga gadis tiba di reruntuhan Tokyo. Di ibu kota yang hancur, pakaian bersih mereka yang luar biasa membedakan mereka. Tapi itu bukan satu-satunya hal yang aneh tentang mereka - mereka juga masing-masing memiliki kekuatan gaib. Mereka menyebut diri mereka "Coppelion," dan sedang dalam misi untuk menyelamatkan orang-orang Tokyo.