Kisah The Empire of Corpses terjadi di Eropa abad ke-19, dan berkisah tentang John Watson. Dia dibina oleh pemerintah untuk menjadi agen rahasia- Namun, Watson hidup di dunia di mana “Frankensteins” – mayat manusia yang digunakan kembali dengan jiwa palsu untuk menggunakannya sebagai buruh – digunakan untuk meningkatkan perkembangan industri.