Meskipun dia baru berusia enam belas tahun dan terlihat lebih muda, Misao Makimachi sudah menjadi anggota klan ninja Oniwabanshu yang terampil dan kompeten. Itu beruntung bagi Misao, karena bakat onimitsu-nya mungkin satu-satunya yang membuatnya tetap hidup ketika sebuah perjalanan mencari pemimpin klan, Aoshi Shinomori, malah membawanya ke pertemuan tatap muka dengan pria yang bahkan lebih berbahaya dan seorang pria. berencana untuk menggulingkan pemerintah Meiji! Dengan cepat terjerat dalam urusan pembunuh legendaris Hitokiri Battosai, yang sekarang dikenal sebagai Kenshin Himura, pengguna pedang pedang terbalik, Misao mendapati dirinya ditarik ke tengah intrik mematikan melawan Makoto Shishio, yang mengatur penaklukan seluruh Jepang – dimulai dengan Kyoto!