Ketika virus penginfeksi hantu yang dikenal sebagai Fire-Starter mulai menyebar melalui sistem yang mengakibatkan pembunuhan Perdana Menteri Jepang, Mayor Motoko Kusanagi dan tim elit operasi khusus dipanggil untuk melacak sumbernya.
Ketika virus penginfeksi hantu yang dikenal sebagai Fire-Starter mulai menyebar melalui sistem yang mengakibatkan pembunuhan Perdana Menteri Jepang, Mayor Motoko Kusanagi dan tim elit operasi khusus dipanggil untuk melacak sumbernya.