Perang antara Euro Britannia dan Uni Eropa terus berlanjut. Pesanan baru diberikan ke Unit W-0. Untuk mendarat di tengah wilayah musuh sebagai pengalih perhatian. Pilot Unit W-0 hanya terdiri dari komandan, Leila, satu-satunya orang Jepang yang selamat dari pertempuran terakhir mereka, Akito, dan tiga orang yang melarikan diri dari Sebelas ghetto dan tinggal di dunia bawah, Ryou, Yukiya, dan Ayano. Dengan semua orang memegang harapan masing-masing, operasi terus berjalan. Di sisi lain di Euro Britannia, Shin, yang membuat dermawannya bunuh diri dengan kekuatan misterius “Geass”, diangkat menjadi pemimpin Knights of St. Michael. Saat Shin terus maju demi ambisinya sendiri, dia dan bawahannya di pasukan Ashura diberi perintah untuk dikerahkan. Orang yang hidup untuk bertarung, dan orang yang berjuang untuk hidup.